Wat is Pcoa?
Wat is Pcoa?

Video: Wat is Pcoa?

Video: Wat is Pcoa?
Video: What is a PCoA/PCA 2024, November
Anonim

PCoA is 'n skaal- of ordeningsmetode wat begin met 'n matriks van ooreenkomste of ongelykhede tussen 'n stel individue en daarop gemik is om 'n lae-dimensionele grafiese plot van die data te produseer op so 'n manier dat afstande tussen punte in die plot naby is aan oorspronklike ongelykhede.

Net so, wat is PCoA-analise?

Hoofkoördinate Ontleding ( PCoA , = Multidimensionele skalering, MDS) is 'n metode om ooreenkomste of ongelykhede van data te verken en te visualiseer. Dit begin met 'n ooreenkomsmatriks of ongelykheidsmatriks (= afstandsmatriks) en ken vir elke item 'n ligging in 'n lae-dimensionele ruimte toe, bv. as 'n 3D-grafika.

Weet ook, wat is 'n ordeningskomplot? 'n Koenokline is 'n grafiese voorstelling van alle reaksiefunksies van spesies in 'n gemeenskap wat langs 'n enkele omgewingsgradiënt geplot is. Gegewe die groot aantal spesies en die hoë geraas in die meeste studies, word koenokliene gewoonlik slegs in hoogs vereenvoudigde vorm vertoon.

Tweedens, wat is die verskil tussen PCA en PCoA?

Terwyl PCA is gebaseer op Euklidiese afstande, PCoA kan (on)ooreenkomsmatrikse wat uit kwantitatiewe, semi-kwantitatiewe, kwalitatiewe en gemengde veranderlikes bereken word, hanteer. Soos altyd is die keuse van (on)ooreenkomsmaatstaf krities en moet dit geskik wees vir die betrokke data.

Wat is nie-metriese multidimensionele skaal?

Nie - metriese multidimensionele skaal (NMDS) is 'n indirekte gradiënt-analise-benadering wat 'n ordening produseer gebaseer op 'n afstand- of ongelykheidsmatriks. Enige ongelykheidskoëffisiënt of afstandmaatstaf kan gebruik word om die afstandmatriks te bou wat as inset gebruik word. NMDS is 'n rang-gebaseerde benadering.

Aanbeveel: